期刊简介
本刊主要刊登有关国内外人体微生态学、动植物微生态学及分子水平的微生态学等各领域的基础研究、应用研究、发展动态、成果和技术方法，包括生态制品（人用、兽用、水产、环境等）的研究、正常微生物群与微环境的平衡关系以及微生态失调造成疾病的防治研究、实验室技术等，以及促进微生态学与生命科学各学科相关领域的学术交流。
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首页>中国微生态学杂志
- 杂志名称：中国微生态学杂志
- 主管单位：中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位：中华预防医学会 大连医科大学
- 国际刊号：1005-376X
- 国内刊号：21-1326/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华预防医学会优秀期刊期刊收录：万方收录(中), 文摘杂志, Pж(AJ) 文摘杂志(俄), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, SA 科学文摘(英), 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 哥白尼索引(波兰), 维普收录(中)
社区获得性ST59型MRSA HZW450的全基因组测序及分析
倪淑君；郭丽华；周佳维；孟晓华；姚坚；吴灵娇；张琼；李兰娟
关键词：社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌, 全基因组分析, ST59, 毒力基因, 药敏试验, 耐药基因型
摘要：目的 对1例脓疱疮患者脓液中分离的1株社区获得性耐甲氧两林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)HZW450菌株进行全基因组测序并对序列信息解析.方法 使用三代测序PacBio技术对HZW450菌株进行全基因组测序,且使用SMRTanalysis v.R2.3.0对该序列进行序列拼接,上传NCBI进行基因功能注释,用RPSBLAST program进行直系同源簇(COG)注释以及毒力因子相关基因和耐药基因分析.同时比较国内其他地区发现的同一序列型(ST)的菌株毒力因子相关基因及耐药相关基因的差异,并比较HZW450菌株耐药基因型与表型的一致性.结果 HZW450菌株的基因组大小为2 831 958 bp,GC占比32.9％,其基因组完成图序列已提交至NCBI GenBank数据库,登录号为CP020741.同时经过分析发现该菌株为ST59型,其基因组中含有许多与致病相关的毒力因子,以及含有耐药基因aph(3’)-Ⅲ、ant (6)-Ia、mecA、norA、erm (B)和cat (pC233),毒力及耐药基因与ST59型其他菌株比较有差异.该菌株临床药敏结果与耐药基因比较分析发现,耐药表型与基因型存在差异.结论 本研究报道了1株CA-MRSA (HZW450)菌株的全基因组序列.基因序列分析显示该菌株携带大量毒力基因,包括lukS-PV、lukF-PV、eta、fnbA、fnbB、sspB、sspC等,编码毒素、粘附、免疫逃逸等相关毒力因子,其毒力较强,致病性较高.
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